Tüp bebekte embriyo dondurma yöntemi son yıllarda sıklıkla yapılmaktadır. Özellikle bazı durumlarda yapılması zorunludur bunlar; 1) Ovaryan hiperstimülasyon sendromu riski olan polikistik over sendromlu hastalarda, AMH değeri 3.5in üzerinde olan ve tüp bebekte 15 den fazla yumurta toplanan veya yumurta olgunlaştırma iğnesi yapıldığında E2 seviyesinin 4000nin üzerinde olması durumlarında embriyo dondurma kararı baştan tüp bebeğe başlamadan alınır 2) Transfer günü rahim duvarının 7 mm den ince olması veya içinde sıvı görülmesi 3) Transfer öncesinde oluşan vajinal kanamalar, 4) Siklusa başlamadan önce gözden kaçan veya tüp bebek sırasında ortaya çıkan endometrial polipler 5) Embriyolara genetik tanı yapılacaksa Bazı durumlarda ise yapılması önerilmektedir bunlar; 1) Taze transferden kalan embriyolar 2) Bir önceki denemesinde başarısız taze embriyo transferi olması 3) Yaygın endometriozis olması Çikolata kisti olması durumunda embriyoların dondurulması önerilir.